为保证服用花粉（及花粉制品）安全有效，必须充分重视对花粉质量的检验。
1）有毒花粉
据文献介绍：烟草，毛地黄，狗胡椒，凌霄花，雷公藤，藜芦等植物花粉具有毒性，不宜服用。此外，已知全株有毒的植物还有30多种，对这些植物的花粉也应作毒性检查，不宜轻易使用。植物性毒素主要是生物碱、氰甙、皂甙等，可用化学分析测定。必要时可做动物试验。有花粉形态图谱的，应做花粉形态鉴定。为防止误用有毒花粉，最好选用单一品种花粉，对无名野花粉、杂花粉应格外注意检验。
2）强致敏性花粉
花粉所含致敏性成分（变应原）对一般人无致敏作用，但会引起某些特殊过敏体质者发生过敏反应症状。各种花粉所含变应原的多少，活性强弱很不一样。人体吸收的变应原活性越强，数量越多越容易发生过敏反应。考虑到个别过敏体质者，虽然吸入空气中的花粉尚未引起“花粉症”，而在大量口服情况下，强致敏性花粉不宜作为普通保健食品。如豚草和三裂叶豚草，前者主要生长在长江流域，后者主要生长在东北地区。据研究，豚草花粉壁所含蛋白质的10%是变应原，像这样的花粉应当慎用。可用形态鉴别法识别。
3）日光曝晒的花粉
新采集的花粉含水量多，不耐储存。据了解有些市售花粉是用日光曝晒法脱水的，这些花粉中的有效成分可能已受到严重破坏，服用这样的花粉或花粉制品当然不会有很好的疗效。如核黄素（VB2）经光照72小时破坏19.5%，VB1、VC等花粉中的许多有效成分都极易受光线破坏。因此，对市售花粉应检查维生素的含量，一般可测定VC及VB2。
4）经高温处理的花粉
为了脱水或灭菌，有些花粉经过加热处理，温度超过50℃，花粉里的活性物质即可能受到不同程度的破坏。经过高温处理的花粉，外观检查可发现颜色变深，表面粘性丧失。还可用氯化三苯基四氮唑法测定花粉的活性。没有活性的花粉不宜选用。
5）严格控制花粉中的霉菌含量
花粉含菌量高的主要原因，往往是收集后未及时脱水或储存方法不当造成的。一般检菌多注意含菌总数和大肠杆菌含量，就花粉来说，还应格外注意检查霉菌。据了解，有些花粉放入食品冷冻库内储存，冷冻库内湿度很大，适于霉菌繁殖，有的霉菌在-12℃仍可发育，许多霉菌的分泌物具有毒性。经过灭菌处理的花粉，按一般方法检菌，可能合格；但灭菌处理却不能消除霉菌分泌的毒素，必要时应测定黄曲霉素。曾被霉菌严重污染或黄曲霉素超过一般仪器标准者，应属不合格品。
6）破壁花粉
在干燥状态下，花粉壁对花粉里面的营养成分有保护作用。破壁花粉，其有效成分接触空气和光线的机会增加，而且容易吸潮，如保管不善，更易染菌、变质。因此，对市售破壁花粉及破壁后放置时间较长的花粉，要格外注意检验。特别要测定水分、灼烧残渣、维生素和含菌量。
据国内外有关资料报道，花粉壁对吸收花粉里的有效成分并无明显妨碍。一般使用不需要破壁，有些特殊产品须将花粉进行破壁（如制备悬浮液），破壁后要注意避光、防潮。
7）经过长期储存的花粉
用充有二氧化碳或氮气的容器包装，并在低温下保存的花粉，有效成分损失较少。在室温下用普通包装保存的花粉有效成分破坏较多，据试验，存放9个月后。赖氨酸、精氨酸等明显下降，维生素C损失率达10%~62%（随花粉种类不同，损失率不同）。一般应当使用当年的花粉，对花粉的氨基酸含量应当进行检验。
由于花粉构造特殊，成分复杂，如处理、保管不善，很易发生变质。所以应引起对花粉质量检验工作的重视。
